Ark Nova: Marine Worlds är en expansion till Ark Nova som introducerar flera nya element i spelet, till exempel det marina livet som måste bo i varje ny specialinhägnad som byggs nära vattnet. Ungefär hälften av havsdjuren bor i rev, och varje gång du lägger till dem i ditt zoo aktiverar du förmågorna hos liknande djur i ditt zoo.

För att hantera den utspädning av kortleken som uppstår när man lägger till nya kort har alla havskort en vågikon, och varje gång de visas på brädet kastas det första kortet i raden och fylls sedan på igen. Det finns ett nytt fjärde universitet på föreningsbrädet, som om det tas ger dig ett av sex specialuniversitet med en forskningsikon och en djurikon från reserven. Om du tar det avslöjar du kort från toppen av kortleken och behåller det första kortet som har den djurikon som motsvarar det universitet du väljer.

Var och en av de fem olika handlingskorten har fyra alternativ med en liten skillnad. I början av spelet tar spelarna actionkort och ersätter sina två vanliga actionkort med dessa nya kort för att öka asymmetrin i spelet. Spelet innehåller också nya bonusbrickor och slutpoängkort.

Den här expansionen innehåller också trämarkörer för de tre spåren och ett sött litet djur som kan användas för att markera projekt istället för de vanliga markörerna.