DK Island anfalls av King K. Roll, men King K. Rolls ö går på grund en bit utanför. För att ta sig till honom och rädda sin ö måste nu Donkey Kong och hans vänner hjälpas åt för att besegra bossarna på ön och slutligen King K. Roll. Ö-världen fungerar lite som en ingångsvärld liknande den i Super Mario 64. På de olika öarna finns det totalt 8 portaler , som leder till olika banor som alla har sitt eget tema.