I Alchemists tävlar två till fyra alkemister om att upptäcka alla hemligheter som deras mystiska vetenskap döljer. Man kan få poäng på flera olika sätt, men de flesta poängen får man genom att publicera teorier, om de är korrekta det vill säga, och det är där det kluriga i spelet ligger.

Spelet spelas under sex rundor. I början av varje runda väljer man spelordning, den som gör sina saker senare får fler belöningar, men riskerar att inte kunna göra exakt det man vill.

Spelare väljer alla sina handlingar genom att placera kuber på olika handlingsrutor, och sedan sker varje handling i ordning. Spelarna får kunskap genom att blanda ingredienser och testa resultatet på en app på sin telefon (iOS, Android eller Windows). Appen skapar varje gång man spelar helt nya förutsättningar. Det går även att spela utan appen, men då behöver man en extra spelare som kontrollerar resultaten.

Vill alkemisterna ha något litet extra, så kan de köpa magiska artefakter för lite olika fördelar. Det finns totalt 9 artefakter, som kan vara olika från spel till spel, men de är inte bara kraftfulla, utan även dyra. Men pengar inte så viktigt, när ditt akademiska rykte står på spel!

Spelare kan även tjäna pengar genom att sälja magiska drycker av varierande kvalitet till äventyrare som kommer till staden, men pengar är inte allt för en alkemist. De vill ha respekt, och det får man främst genom att publicera teorier.

Under spelet kommer spelarnas rykte att gå upp och ner. Efter sex rundor och en sista uppvisning förvandlas spelarnas rykte till poäng. Man får även poäng från artefakter och stipendier. Sedan avslöjas hemligheterna och spelare får eller förlorar poäng beroende på om deras teorier var korrekta eller inte.